G-Blender

Saludos,

El caso es que he creado las texturas desde zbrush y se veía bien sobre el modelo. Pero al aplicar las texturas en blender, en una zona en concreto, es como si se "mezclase".

He editado las texturas desde gimp2 pero el resultado es el mismo.

Como podría arreglar-lo?

Pues ni idea.. pero puedes probar a que no fueran caras invertidas o zonas duplicadas.
Prueba a ver si seleccionando todos los vértices y presionas Ctrl+N (recalcular normales) y luego W > Remouve Doubles por si hubieran vértices repetidos.
Si no es eso, tal vez te tocará pintar sobre el modelo con Texture Paint en la zona que dices que sale mal.